A coleção Entomológica possui cerca de 130.000 indivíduos registrados e quase 100.000 para processamento. O acervo é conservado em via seca com alfinetes entomológicos e subdividido em: Coleoptera, Diptera e Hymenoptera. A curadoria de Diptera e Hymenoptera iniciaram na década de 1970 pelos professores Kiniti Kitayama e Frei Kempf, respectivamente. Em 2012, a Profa. Dra. Marina Regina Frizzas iniciou a coletar e catalogar os espécimes de Coleoptera do acervo. O foco das curadorias é voltado para o Cerrado.
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